Matthias Höfele studierte von 1983 bis 1987 an der Musikhochschule Karlsruhe Klarinette bei Prof. W. Meyer und Klavier bei J. Scherrer. Von 1987 bis 1989 setzte er das Studium der Klarinette bei Prof. W. Wandel an der Musikhochschule Trossingen fort.

Seine Laufbahn als Orchestermusiker begannHöfele 1988 als stellvertretender Solo-Klarinettist am Schleswig-Holsteinischen Landestheater in Flensburg. 1994 wechselte er nach Berlin, wo er als Solo-Klarinettist an der Komischen Oper engagiert wurde. In gleicher Position ist er seit der Spielzeit 1999 Mitglied beim Orchester der Deutschen Oper Berlin.

Matthais Höfele ist Mitglied in mehreren Kammermusikvereinigungen, darunter das Kammerensemble Classic Berlin und das Klarinetten-Trio Berlin. Weiterhin spielt er als Solo-Klarinettist bei den Wagner-Festspielen in Bayreuth.